Основной ячейкой станции является цех.
На АО «Ангренская ТЭС» имеется шесть основных цехов: топливно-транспортный цех, котлотурбинный цех №1 (мощн.130-150МВт), котлотурбинный цех №2 (мощн. 243 МВт), электрический цех, цех тепловой автоматики и измерений, цех тепловой и подземных коммуникаций, а также четыре вспомогательных цеха: химический цех, ремонтно-строительный цех, цех наладки и испытаний оборудования, цех централизованного ремонта.
Имеются также подразделении: служба логистики, лаборатория металлов и сварки, отдел материально-технического снабжения.
Форма управления предприятием основана на единоначалии во главе с Генеральным директором станции.
Для руководства хозяйственной деятельностью предприятия, в административном подчинении у Генерального директора имеется директор по производству, директор по общим вопросам, директор по перспективному развитию и инвестициям, бухгалтерия, отдел экономического прогнозирования и трудовых отношений (ОЭП и ТО), отдел кадров, юрисконсульт, ОКС, АХО, 2- отдел.
Для организации технической деятельности предприятия имеется производственно-технический отдел (ПТО).
Производственно-технической деятельностью станции руководит генеральный директор через директора по производству, в оперативном подчинении у которого находятся: начальник службы по эксплуатации, начальник службы по ремонту, ПТО, основные и вспомогательные цеха, начальники смены станции, инспектора по ПТЭ,ПТБ, ППБ, лаборатория металлов, отдел по подготовке и проведению ремонтов (ОППР).
Для руководства работами по капитальному строительству предприятие имеет отдел капитального строительства и для реализации инвестиционных проектов группа реализации инвестиционных проектов.
Распределение функций и границ по эксплуатации и ремонту оборудования, зданий и сооружений станции между цехами и производственными подразделениями определено соответствующими Положениями о цехах, а также «Положением о функциях и распределении границ ответственности за эксплуатацию и ремонт оборудования, зданий и сооружений между структурными подразделениями АО «Ангренская ТЭС».
